El nombre de la institución fue tomado de la sobrina del cacique Calarcá, perteneciente a la tribu de los Fijaos de la cultura indígena Quimbaya, quienes inicialmente habitaron este territorio.El proyecto fue elaborado y presentado a la Secretaría de Educación Municipal, donde fue apoyado, dándose comienzo al proceso de gestión y dinamismo requerido para la dotación de esta institución educativa. Entre tanto, la comunidad requería una solución acorto plazo, por lo cual solicitó al gerente del INURBE, el préstamo de la casa modelo de Ciudad Boquía, y allí empezó a funcionar la INSTITUCIÓN EDUCATIVA CIUDAD BOQUÍA.

Posteriormente, hacia el año de 1992 y debido a que fueron adjudicadas nuevas soluciones de vivienda, crece la demanda de cupos escolares, la necesidad de ampliar la planta de personal docente y por lo tanto tener una infraestructura más amplia que permita albergar un mayor número de estudiantes.